Цель создания Субстанциональной теории атома
сформулирована вполне конкретно, она вполне
понятна даже студентам. Другое дело, что достичь
её не просто. Но каких-то принципиальных
(системных) ограничений пока не выявлено.

По поводу же двух типов молекул водорода
вопрос также сформулирован вполне конкретно.
Есть пара- и ортоводород

https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9C%D0%BE%D0%BB%D0%B5%D0%BA%D1%83%D0%BB%D0%B0_%D­0%B2%D0%BE%D0%B4%D0%BE%D1%80%D0%BE%D0%B4%D0%B0#:~:text=%D0%9C%D0%BE%D0%BB%D0%B5%CC%81%D0%BA%D1%83%D0%BB%D0%B0%­20%D0%B2%D0%BE%D0%B4%D0%BE%D1%80%D0%BE%CC%81%D0%B4%D0%B0%20%­E2%80%94%20%D0%BF%D1%80%D0%BE%D1%81%D1%82%D0%B5%D0%B9%D1%88%­D0%B0%D1%8F%20%D0%BC%D0%BE%D0%BB%D0%B5%D0%BA%D1%83%D0%BB%D0%­B0%2C%20%D1%81%D0%BE%D1%81%D1%82%D0%BE%D1%8F%D1%89%D0%B0%D1%­8F,%D1%8F%D0%B4%D1%80%D0%B0%D0%BC%D0%B8%20%D0%BE%D0%B1%D1%80%D0­%B0%D0%B7%D1%83%D0%B5%D1%82%D1%81%D1%8F%20%D0%BA%D0%BE%D0%B2­%D0%B0%D0%BB%D0%B5%D0%BD%D1%82%D0%BD%D0%B0%D1%8F%20%D1%85%D0­%B8%D0%BC%D0%B8%D1%87%D0%B5%D1%81%D0%BA%D0%B0%D1%8F%20%D1%81­%D0%B2%D1%8F%D0%B7%D1%8C.

Отличие их вроде как описывается через спины.

Большинство материи в космосе представлено
атомарным водородом. Но что-то же заставляет
водород при более тесном взаимодействии
спариваться, значит есть причины. Их нам и
нужно выяснить. Или правильнее сказать - отразить.