Нет, это не идея. Частицы и античастицы рождаются парами и они равномерно перемешаны. Нет механизма, который бы привел к сгруппированию частиц и античастиц в разных вселенных.

У меня есть ещё одна идея, про черные дыры я уже забыла.
Но я её не скажу, не проверена.

CASTRO, рада Вас видеть.  
Гипотезы может и популярны, но гипотеза должна иметь адекватное объяснение, почему разнесены.
Здесь был Gavial с гипотезой, что мир и антимир разбежались в разных направлениях, потому что время в антимире течет в обратном направлении в 4D пространстве. Его гипотеза не выдежала критики, и он исчез с форума.

И какой механизм?

Первое, что приходит в голову о разделении в пространстве материи .и антиматерии.
1. Во время большого взрыва первыми родились  две гигантские частица и античастица, каждая массой со Вселенную, и разлетелись в разные стороны. Затем каждая распалась на множество частиц, образовав Вселенную и Антивселенную

Второе, что приходит в голову
2. Расширяющаяся горячая Вселенная, первоначально заполненная супом из фотонов частиц и античастиц, почему-то неравномерно перемешалась. После аннигиляции остались островки материи и антиматерии, удерживаемые собственными гравитационными силами, которые потом были разнесены на большое расстояние расширением вселенной. Здесь много вопросов. Почему материя неравномерно перемешалась, была инфляция, никакого перемешивания не могло быть. Какой размер островов, является ли один остров целой Вселенной, или её частью.

Третье, совсем фантастика
3. Какие-нибудь неизвестные свойства темной материи. Допустим, темная материя притягивает вещество и отталкивает антивещество. Или есть два вида темной материи, отталкивающиеся друг от друга. Один вид притягивает вещество, другой антивещество.