Да как и во всей российской археологии, православная археология  ее часть, занимающаяся православными памятниками. Есть методология, по которой археология работает. Копает, обрабатывает, анализирует, сравнивает, изучает источники.... что там положено, то и делает.Верификация вроде как венским кружком введена, неопозитивизм это. Ну а по костям, соответственно, методами антропологии и генетики определяют , что это за вид такой в могиле лежит. Что касается до влияния чудес на реальность, то одно из таких явлений  хорошо описано, в нем принял участие видный антрополог ММ Герасимов  , который принимал непосредственное участие во вскрытии мощей Тимура.Тот факт, что предсказание было написано на листах 19 века, никак не отменяет существования самого предсказания о начале войны, а только снижает время предсказания. Этот вопрос не так давно специально обсуждался на форуме археологов, хотя сам вопрос о предсказаниях не является предметом науки археологии, сами археологи им интересуются, так же как и различными мировозрениями народов оставивших раскапываемые ими останки..