Не надо ничего учитывать...  Он сам состоит из этих "атомогалактик", как мы с Вами из атомов.
Этот ранее придуманный демиург "живёт" в нашей же Вселенной - просто масштаб другой.
Не тёмная ли это материя, кстати? Только поправочка - она макро, а не микро...  

а есть ли какие практические доказательства тому что темная материя существует и там присутствует? или она существует лишь в виде умозаключения?

Точнее, ускорение силы тяжести галактического ядра не убывает, "как положено", к периферии галактики, откуда вывод о дополнительной массе, именно, на периферии объекта.

Почему ТМ - это непременно материя, как и обычная, в виде частиц?
Вот Вы говорите, что ТМ образовала крупномасштабную структуру. Мы знаем, что ТМ проявляет себя только через гравитационные эффекты. А что такое гравитация? Правильно, это искривление пространства. И мы говорим, что если есть искривление, то обязательно должен быть материальный объект, который за этот эффект (искривления пространства-времени) отвечает.
Если пространство-время имеет свою динамику, то у него должны быть свои какие-то флуктуации, какая-то структра.
Вот давайте эту картинку, где объекты трёхмерного пространства спроецированы на двумерную плоскость, преобразуем в "двумерновременную", такую, где обычно рисуют искрислённую гравитацией плоскость:



вот в такую:



Получится "апельсиновая корка" на крупном масштабе, в углубления которой и застряёт "звёздная пыль". ( )
А почему не может быть устойчивых искривлений пространства-времени, таких как рукава галактик, таких как нитеобразные кластры галактик, в которые и скатываются материальные объекты, как в циклонный пылесос? (Та же ТГВ Бурланкова, например) У нас всё "пляшет" вокруг материи... а зря.



Расположите массивный объект на скате горба - он просто обязан будет двигаться в гравитационное "углубление", которое является гравитирующим даже без наличия там материи. Иначе будет нарушение законов физики...  8)